vmd 다운로드

비주얼 분자 역학(VMD)은 여러 플랫폼에서 사용할 수 있는 생체 분자의 모델링, 시각화 및 분석을 위한 강력하고 자유롭게 사용할 수 있는 소프트웨어입니다. VMD를 통해 연구원은 완전히 3차원 공간에서 구조를 빠르고 쉽게 나타낼 수 있으며 단백질 데이터 뱅크(PDB) 및 CCDC 파일과 호환됩니다. VMD 소프트웨어는 어바나 샴페인의 일리노이 대학의 이론 및 전산 생물 물리학 그룹에서 다운로드 할 수 있습니다. 다운로드 할 수있는 표현에서 코발트 원자는 노란색으로 표시되고 질소 원자는 진한 파란색으로 표시됩니다. 탄소 원자와 산소 원자는 각각 밝은 파란색과 빨간색으로 표시됩니다. 이 구조는 게시되지 않습니다(Brasch 그룹). 먼저 소프트웨어를 다운로드하여 설치하고 보고 싶은 분자에 대한 파일을 다운로드해야합니다. VMD를 시작하면 주 창, 표시 창 및 필요하지 않은 상태 창의 세 개의 창이 즉시 열립니다. 그러나 VMD로 작업하는 동안 창을 닫지 마십시오! 기본 창을 사용하여 PDB 파일을 엽니다(파일/새 분자, 파일 이름을 찾아보고 로드를 클릭). VMD가 네 번째 창을 열었기 때문에 기본 창으로 돌아가서 열어 놓은 PDB 파일에 해당하는 VMD 파일을 열어야 합니다(파일, 시각화 상태 로드, 파일 이름 찾아보기).

이제 디스플레이 창으로 이동하면 왼쪽 마우스 버튼을 길게 누르고 마우스를 이동하여 회전 할 수있는 분자가 표시됩니다. VMD 사용자 조사 결과 VMD 개발 상태 및 시험판 테스트 다운로드 CVS 소스 코드 액세스 VMD 프로그래머의 문서 OpenGL 디스플레이 창은 선택한 분자의 그래픽 표현을 표시하고 색상, 재료 및 라벨은 VMD의 전용 모듈에서 사용자 정의 할 수 있습니다. 또한 원하는 라이트, 축 또는 배경 유형을 선택할 수 있도록 디스플레이 옵션을 쉽게 수정할 수 있습니다. 많은 분자는 기본적으로 응용 프로그램과 함께 번들로 제공됩니다. 그러나 사용자는 또한 응용 프로그램의 분자 파일 브라우저 기능을 사용하여 프로그램에 더 많은 분자를 추가 할 수 있습니다. 이 프로그램에는 로드된 파일 유형을 자동으로 감지하는 지능형 기능이 있습니다. 그러나 응용 프로그램 검색 기능이 정확하지 않은 경우 파일 크기를 수동으로 선택하는 옵션이 있습니다. VMD는 단백질뿐만 아니라 다른 유형의 분자를 처리하는 데 직접 관여하는 유틸리티 중 하나입니다. 이러한 파티클의 복잡한 구조를 보는 데 사용할 수 있지만 위에서 언급 한 영역에서 경험이있는 사용자는이 도구를 최대한 활용할 수 있습니다.